与外部合作伙伴的合作经常被认为是使非营利组织更有效地推进其使命的首要任务。合作可以采取许多不同的形式:从组织之间关于信息共享的非正式理解到正式的合作协议创建区域章节，从非营利组织和营利性组织之间的合资企业到两个或多个非营利组织之间的合并。在建立合作关系之前进行适当的尽职调查，在书面协议中提供适当的条款和条件(以确保合规和风险管理)，理解事务的性质和任何潜在的替代方案对于管理和治理组织的最佳利益都是至关重要的。